Membranproteine

[teresa123]

schönen guten Abend!
Kleine Frage, denn ich bin mir nicht sicher. Sind integrale Membranproteine durchgehend hydrophob?? Oben und unten natürlich nicht, aber innerhalb der Membran??
Bedanke mich schoma!

 

[Joffi]

Ganz allgemein erstmal: Dogmen gibt es bei biologischen Themen NIE!
Und spezieller: In einer die Membran durchstoßenden alpha-Helix können auch mal hier und da eine nicht-hydrophobe Aminosäure sitzen. Wenn man ein Protein dahingehend analysiert, nimmt man sich in der Regel eine paar Aminosäuren (sagen wir 10), berechnet, wie hydrophob wie in der Summe sind und verschiebt dann sein 10er-Fenster eine Aminosäure weiter. Berechnet wieder, verschiebt wieder, berechnet wieder, usw. usf.. Dann erhält man eine Art Profil der Gesamt-Aminosäuresequenz. Dort, wo Bereiche großer Summenhydrophobie zusammenfallen mit der Möglichkeit eine alpha-Helix, kann man dann als Hypothese eine Membrandomäne annehmen (bis einem jemand das Gegenteil beweist ).

 

[teresa123]

Hmm...okay..
ich glaube ich habe verstanden
Aufjeden Fall vielen vielen Dank!
Ist auf jeden Fall eine Hilfe!!!