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A
anaerob
Gast
wer kann mir mal das prinzip von SDS PAGE einfach erklären??
Erst mal zur Bedeutung: PAGE steht für "Polyacrylamid Gelelektrophorese", SDS für "Sodium dodecyl sulfate" (dt.: Natriumdodecylsulfat oder auch Natriumlaurethsulfat).
Acrylamid ist gemischt mit einigen Chemikalien in der Lage zu polymerisieren und dadurch eine gel-artige Konsistenz anzunehmen (Polyacrylamid). In einem solchen Gel kann man jetzt Proteine Ihrer Größe nach auftrennen. Hier kommt jetzt SDS ins Spiel: Man will, dass die Proteine in einem Spannungsfeld durchs Gel wandern. Nun haben Proteine aber eine Tertiärstruktur (und laufen nativ also nicht entsprechend Ihrer Kettenlänge) und sind außerdem nicht definiert geladen (sondern jedes Protein hat seine typische Ladung). Beides löst SDS: Es lagert sich an die Aminosäurekette und entfaltet das Protein. Außerdem ist SDS negativ geladen und überlagert die Ladung des Proteins, so dass alle Proteine negativ geladen erscheinen und in die gleiche Richtung des Feldes laufen. Je länger eine Aminosäurekette, umso langsamer wandert sie durchs Gel. Nach einiger Zeit hat man also alle Proteine einer Probe der Länge nach sortiert.
Acrylamid ist gemischt mit einigen Chemikalien in der Lage zu polymerisieren und dadurch eine gel-artige Konsistenz anzunehmen (Polyacrylamid). In einem solchen Gel kann man jetzt Proteine Ihrer Größe nach auftrennen. Hier kommt jetzt SDS ins Spiel: Man will, dass die Proteine in einem Spannungsfeld durchs Gel wandern. Nun haben Proteine aber eine Tertiärstruktur (und laufen nativ also nicht entsprechend Ihrer Kettenlänge) und sind außerdem nicht definiert geladen (sondern jedes Protein hat seine typische Ladung). Beides löst SDS: Es lagert sich an die Aminosäurekette und entfaltet das Protein. Außerdem ist SDS negativ geladen und überlagert die Ladung des Proteins, so dass alle Proteine negativ geladen erscheinen und in die gleiche Richtung des Feldes laufen. Je länger eine Aminosäurekette, umso langsamer wandert sie durchs Gel. Nach einiger Zeit hat man also alle Proteine einer Probe der Länge nach sortiert.