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Hallo Community,
die Frage ist welche Konsequenzen es für ein PCR-Experiment hätte, wenn fälschlicherweise beide flankierenden Primer an den oberen Strang binden würden?
Ich würde mich über eine Antwort freuen
Das wäre doof Die beiden Stränge laufen ja in entgegengesetzte Richtungen und auch die Polymerase läuft nur in eine vorgegebene Richtung pro Strang. Setzt man die Primer auf den gleichen Strang, läuft die Polymerase von dem einen Primer von hinten auf den anderen auf und schmeißt ihn runter. Man vermehrt dann bei jedem Zyklus linear (statt exponentiell) seinen Zielbereich, aber ohne definierte Länge und eben nur einen Hauch davon (weil X Produkte/Zyklus halt nichts ist verglichen mit x*2^Zyklus Produkte).